李令哲的出現令漢臣措手不及，漢臣們個個黔驢技窮，只得怨天尤人。迫于形勢漢臣們不得不一起倒戈，請求嚴辦明史一案，并同時稱病避朝，也為求能夠明哲保身，玄燁為此怨聲載道，失落至極。孝莊到獄中探望陸健，說服其以身殉國，成全帝皇的穩定統治，也能就此了結明史一案，以平息天下之亂與朝中的滿漢之爭。陸健深明其中之意，為成全大局毅然喝下毒酒。此時皇太后病危，玄燁卻在獄中陪伴老師陸健，遲來的玄燁沒能阻止陸健赴死，陸健臨死之前交出認罪書，并囑咐玄燁，望其能在將來為明史一案平反。悲痛之中的玄燁趕到壽康宮見皇太后最后一面，痛上加痛的他更是傷心欲絕，心疼三哥哥的冰月也情不自己安慰著玄燁。隨著皇太后的薨逝，孝莊下令天下大赦，歷時兩年的明史一案就此落幕。