使用魔術手法在全世界范圍內進行盜竊的大怪盜·怪盜基德，在時隔8年后首次現身。

喜愛魔術的高中生黑羽快斗，在同學的面前發出了要與基德一決勝負并將其逮捕的宣言。當天，基德對正在小野銀行中展示的寶石“月之瞳”發出了盜竊預告。回到家中的快斗意外發現了已經去世的魔術師、父親黑羽盜一留下的密室，房間中不知為何存放著與怪盜基德一模一樣的服裝。快斗抱著見到基德就會知道些什么的想法前往小野銀行，因此知道了盜一之死的真相，以及盜一不為人知的一面……