一輛在宇宙行駛的列車遭受隕石撞擊而動彈不得，有紀涉率領銀河鐵道警備隊前去救援，但有紀涉的兩個兒子，護和學，卻也跟著偷溜上車。此時宇宙中出現了一個白洞，并且由里面出現了敵方戰艦，開始攻擊警備隊的列車…。