Chuck大學時期的教授，發明數據庫的科學家被不明身份的殺手追蹤，Chuck等人奉命調查此事件。而這次任務，也打開了小宅男那封閉了數年的心扉。也第一次開始了關于Chuck起源的描述。隨著調查的深入，關于Bryce陷害Chuck的往事也出現了新的轉機。

因為“兼職工作”的耽誤，Chuck錯過了Buy More的副經理競爭，Harry開始了他黑暗的統治，而以Morgen為首的自由力量，會讓Harry統治下去么？