日本平戶，懷有身孕的翁子被摻扶上一艘日本商船，她要在孩子出世之前趕回中國，回到丈夫鄭芝龍身邊。風浪中，孩子出生了，是個男孩，4個男仆都不會接生，他們望著眼前的情景不知所措，翁子咬斷孩子的臍帶，孩子大哭。這時風平浪靜，天空出現吉祥的彩云，落日將海天染得血紅一片。 5歲的鄭森被父親在海中摔打，海盜出身的父親鄭芝龍用異乎尋常的方法訓練鄭森，一心想把兒子培養成像自己一樣堅毅果敢的人。 16年后，21歲的鄭森已是南京國子監的學生，這時的南京已是清兵壓境，危機四伏。 一日，鄭森的堂哥，掌管鄭芝龍家族"五大商行"的鄭泰來南京結款，準備順便帶鄭森離開南京返回福建。鬧市中，自清兵入關便閉戶不出的秦淮藝妓柳圓圓競價買身，為抗清義士黃梧籌款，一時間南京城的王孫貴族、商賈巨富爭相目睹柳圓圓的芳容。 鄭森為支持黃言北上抗清，不顧鄭泰勸阻，以五千兩黃金打動了柳圓圓，鄭泰大為光火，兄弟倆發生了激烈的爭吵。 當夜，鄭森婉拒以身相許的柳圓圓，柳圓圓以一曲《梅花操》答謝鄭森。在柳圓圓的引見下，鄭森見到了抗清義士黃梧，但黃梧心胸狹隘對鄭森很不友好。 仙霞關，鄭森巧遇逃亡之中的唐王朱聿健，神秘莫測的唐王說鄭森不是凡人，將會承擔起弘復天道的重任，鄭森雖然沒有看見唐王的面容，但暗夜之中朱聿健頭頂漂浮的彩云吸引了鄭森的靈魂。 清兵包圍了客棧，鄭森為救唐王身陷絕境，丐幫幫主陳永華從天而降，率弟子救了鄭森和唐王。 鄭森感激陳永華，他見陳永華非凡俗之胎，必須成就大業，希望陳永華相助。陳永華說大明、滿清都不容丐幫，只要鄭森能接納，愿以死相隨共謀大業。鄭森與陳永華引為知己，陳永華叮囑鄭森，必須馬上回去搬救兵，因為此時只有你父親鄭芝龍能擋住清兵，一旦仙霞關被破，八閩就完了。 海邊，鄭森飛馬趕到，三叔鄭芝魁告訴他鄭芝龍正在臺灣與荷蘭人談判，現在風急浪高，沒有鄭芝龍的命令誰也不能動兵船。鄭森說我已不是凡人，有沒有船我都要去臺灣找父親。隨即他就跳進海里，鄭芝魁見狀連忙就救起侄兒，給了他一艘兵船。年少的鄭森一到臺灣港口岸邊，即被荷蘭士兵團團圍住。