阿衡之死令黃藥師傷心欲絕，遂決定與阿衡一同離開桃花島，周伯通見狀，笑謔黃藥師與阿衡一同尋死，更說出郭靖早已背熟九陰真經，黃藥師聞言大怒。原來黃藥師發誓，凡懂九陰真經者死，因而往殺郭靖，郭靖不知情，大感莫名其妙，后周伯通將經書撕毀，終冰釋干戈，但黃藥師不許黃蓉跟隨郭靖等人離開桃花島。黃蓉思念郭靖，遂毅然向黃藥師辭行，卻見黃藥師與阿衡同在冰牢內，黃藥師已一頭白發，而母親已死去。