孫承宗堅信袁崇煥能旗開得勝，打敗努爾哈赤七萬鐵騎。袁崇煥站在城樓，仔細查看兩軍的戰況，明軍越戰越勇，打退了努爾哈赤的部隊一次又一次地進攻。皇太極帶人越過大炮的死角地帶，將士們用盾牌作掩護，齊心協力鑿城墻，祖大壽用石頭拼命砸向他們，可是盾牌防護嚴密，絲毫不能動搖他們的防衛，祖大壽立刻拿來弓箭，試圖從縫隙里射穿他們，可是根本射不透，眼看城墻即將被鑿開，袁崇煥立刻派趙率教帶預備隊到城下守衛，絕不許任何一個金軍進城。

皇太極的部隊很快鑿穿了四個大洞，努爾哈赤下令全線出擊，袁崇煥集中大炮火力，全力阻擋大軍的進攻，程本直和孫靈汐也來到城墻，孫靈汐提議把火藥直接倒下去，然后點燃，就可以阻止金軍鑿墻，袁崇煥立刻下令傾倒火藥，并讓大炮阻止努爾哈赤的大軍靠近，孫靈汐親自到城樓指揮，火藥迅速燃燒，金軍被燒得鬼哭狼嚎，狼狽逃竄，皇太極的計劃徹底泡湯，他氣得大呼小叫，努爾哈赤眼看大勢已去，只好帶兵撤退。

金軍傷亡慘重，不但損兵折將，還損失了很多武器彈藥，代善自愿承擔一切罪責，努爾哈赤不甘心，決定帶兵攻打南門，皇太極當場提出異議，可努爾哈赤心意已決。袁崇煥帶領將士們稍事休息，程本直斷定努爾哈赤不會善罷甘休，下午的戰事會更加慘烈，程本直斷定努爾哈赤一定會主攻南門，祖大壽信心百倍，要與南門共存亡，孫靈汐特意準備了熱粥給將士們暖身體，不許他們吃冷的干糧。

努爾哈赤率隊卷土重來，集中火力攻打南門，還利用器械向城樓拋石塊，祖大壽帶領戰士們奮勇還擊，可是金軍的火力強勁，明軍死傷無數，祖大壽只好先讓將士們躲起來，金軍很快沖到城樓下，并支起長梯準備登程，祖大壽讓大家向下滾木礌石，打退了一次又一次的進攻，努爾哈赤一聲令下，金軍全線出擊，一起向寧遠城進發。

金軍破門而入，一部分人進了城門，就在這時，一個巨大的柵欄擋住城門，金軍被困在里面，趙率教帶領明軍和金軍展開肉搏戰，很快將他們全部殺死。努爾哈赤只好帶隊撤走，他氣得火冒三丈，向范文程詢問對付袁崇煥的對策，范文程決定連夜攻城，還要修書一封，利用袁崇煥父親的死來動搖他的軍心。

袁崇煥很快就接到努爾哈赤的信，他在信里譴責袁崇煥不孝，孫靈汐很擔心，袁崇煥看完信，立刻集合所有的將士，當眾宣讀了努爾哈赤的信，袁崇煥鼓舞大家誓死堅守寧遠城，絕不后退，袁崇煥也做好了和努爾哈赤魚死網破的準備。孫靈汐連夜給將士們送來棉被，讓大家原地休息，她親手給袁崇煥蓋上棉被，突然城外飛來一只箭，射中了孫靈汐，袁崇煥讓小蘭照顧孫靈汐，他急忙叫醒將士們，準備和努爾哈赤決一死戰。

孫承宗徹夜難眠，他惦記著袁崇煥前方戰事，連夜寫了兩封一模一樣的奏折，想替袁崇煥在朝中斡旋，梁廷棟一直守在旁邊照顧孫承宗，他堅信袁崇煥會旗開得勝，即使袁崇煥打了敗仗，梁廷棟也會竭盡全力幫袁崇煥。努爾哈赤連夜帶兵攻打寧遠城的西門，他下了死命令，即使步兵全部戰死，他會讓騎兵全力沖上前。滿桂帶隊前來支援，明軍苦撐了一夜，金軍始終沒有攻破城門。

第二天一早，代善提議再一次攻城，皇太極卻提議撤兵，兩軍交戰一天一夜，金軍傷亡慘重，如果再不撤退，努爾哈赤多年的心血就傷亡殆盡了，莽古爾泰堅決不干，還對皇太極大呼小叫，努爾哈赤當場決定暫時休整，再重整旗鼓。祖大壽清點了剩下的將士，已經不足八百人，而且彈藥也用光了，滿桂表示誓死堅守寧遠城，祖大壽，謝尚政一致提出和袁崇煥并肩作戰到最后一刻，袁崇煥發誓與寧遠共存亡。