狄府外重兵把守，狄仁杰見此便讓元芳馬上去將張柬之和國(guó)師弘毅請(qǐng)到府內(nèi)，然后再查探下近期內(nèi)是否有武氏子弟意外身亡的消息。狄府前門重病把守他們自是進(jìn)不去，鄰居家的密道也走不得，狄仁杰只好巧用爆竹之計(jì)從后門中的暗道回進(jìn)入狄府。

狄春不解狄仁杰為何不留在沈府，反倒要重回狄府。狄仁杰只道自己家里才是最安全的，他在狄府發(fā)現(xiàn)了四個(gè)可疑的點(diǎn)。第一，打掃房屋讓客人入住是人之常情，但是將客廳布置一新則大可不必。第二，這種大戶人家端茶的理應(yīng)是女仆，他卻用了一個(gè)笨手笨腳的壯漢，還有這個(gè)仆人的服飾和新用的抹布都是新的，這不合常理。第三，這個(gè)仆人灑了茶水之后慌忙道歉，說在下該死，在下這個(gè)詞一般是江湖中人才用得到。第四點(diǎn)則是那個(gè)香爐，他在香爐上發(fā)現(xiàn)了血跡，聯(lián)系到這一系列的反常，他猜想在他們到達(dá)之前那里可能發(fā)生過一場(chǎng)血案，所以這才將客廳布置一新，目的就是為了偽造現(xiàn)場(chǎng)。

張柬之與國(guó)師到府后，狄仁杰將此行的收獲告訴了他們。陽(yáng)明宮不過是幾間破草屋而已，別說是青銅樹，就連一件青銅器皿他們都未曾找到，不過倒是找到了一個(gè)三辰儀。國(guó)師一見到三辰儀便認(rèn)出了此物，此物乃是他的恩師李淳風(fēng)精研多年之物，能察天象識(shí)地理，神秘莫測(cè)。話畢，他拿出了一張青銅樹畫紙一番侃侃解說。調(diào)查陽(yáng)明宮一事只有國(guó)師與太平公主兩人知曉，可消息卻無端走漏，現(xiàn)在國(guó)師對(duì)著這三辰儀又一番侃侃解說，還帶著圖紙，狄仁杰突然想起忘風(fēng)道長(zhǎng)的坐化極有可能還有另一層含義，現(xiàn)在他最好的辦法就是與之周旋，因勢(shì)利導(dǎo)。

國(guó)師帶著圖紙和三辰儀給狄仁杰、張柬之做了進(jìn)一步的研究和講解。而另一邊，元芳也奉命來調(diào)查武氏子孫的靈堂，他到棺木旁查看卻意外發(fā)現(xiàn)棺木底是空的，恰巧此時(shí)，靈堂旁邊的一密室打開了門，幾人從密室中走出。待幾人走遠(yuǎn)后，元芳進(jìn)入了密室查看，密室之中是一處染坊，蹊蹺的是里邊所染的布居然是黑色的，而且邙山寺的供奉的那尊蛇妖像也出現(xiàn)在了這里，元芳想上前查看卻無意中發(fā)現(xiàn)了另一些東西，在沉家堡攻擊他們那些人所穿著的黑衣服、箭頭以及黑蛇，元芳看這一切似乎是明白了什么，他收集了一塊黑布打算帶回去給狄仁杰查看。

密室之中突然出現(xiàn)了另一神秘黑衣人，元芳與她交起手來，最終神秘黑衣人被元芳打倒在地。元芳上前揭開了黑衣人的面罩，這才發(fā)現(xiàn)她居然是南雁。兩人離開了密室之后元芳問起南雁是否跟蹤他，南雁只道元芳想太多了，便向前離去。

國(guó)師向狄仁杰和張柬之講解了青銅樹其中的玄妙，狄仁杰認(rèn)為此事有必要讓朝中百官知曉，而他現(xiàn)如今是戴罪之身不便出面，此事只好讓張柬之來完成。國(guó)師和張柬之離開后，元芳也回到了狄府，他告訴狄仁杰事情確實(shí)是如狄仁杰所料，現(xiàn)所有的線索他已經(jīng)掌握了，狄仁杰決定明日就開始反擊。

第二日，張柬之在朝堂之上告訴眾人他已經(jīng)破解了青銅樹的秘密，他讓武三思在今晚子時(shí)將文武百官召集到上陽(yáng)宮的青銅樹前，他將為眾人揭密。子夜時(shí)分，國(guó)師帶著三辰儀來到了青銅樹前，他將三辰儀放到了青銅樹前道出一番深刻含義的話，武三思認(rèn)為國(guó)師與張柬之就是在胡說八道，妖言惑眾，便想命人將他們押入大理寺。恰巧此時(shí)，太平公主帶著另一節(jié)青銅樹枝也趕到了上陽(yáng)宮，她將青銅樹枝安上去之后國(guó)師道出了青銅樹上的偈語(yǔ)，偈語(yǔ)中有著挽救武周王朝的辦法。

武三思與武懿宗認(rèn)為國(guó)師就是在危言聳聽，兩人仗著自己手中的權(quán)力想以太平公主盜走青銅枝條，挾持陛下為由拿下太平公主，太平公主亮出了自己的免死金牌，可兩人還是依舊不肯罷休。就在此時(shí)，國(guó)師身旁的隨從卻亮明身份，站了出來為太平公主說話，原來這兩人竟是戴著人皮面具的狄仁杰與李元芳。

狄仁杰告訴眾人取走青銅枝條和轉(zhuǎn)移陛下一事皆是他與元芳所為，與太平公主無任何關(guān)系。武三思聽此還想仗著自己的權(quán)利取了狄仁杰的性命，狄仁杰聽道他的命只有當(dāng)今天子才可以定奪。話畢，他便請(qǐng)了武則天出來臨朝聽政。武三思和武懿宗看到武則天都大吃一驚，連忙聲聲為自己辯解，將事情都推到了狄仁杰身上。幸虧是武則天明察秋毫，她一道旨意恢復(fù)了狄仁杰的官位。

朝堂上，狄仁杰為眾人解開疑惑。原來從大震以來所發(fā)生的種種案件均是一個(gè)危害天下且圖謀深險(xiǎn)的逆賊組織所為，他們的目的便是要借天災(zāi)而興人禍，先以蛇蟲制造恐怖輿論，繼而以?shī)Z糧撼動(dòng)朝廷的權(quán)威，然后將這一切都假以天罰的借口蠱惑民心，崩潰朝政，最后便趁著天下大亂之時(shí)，用搶奪來的賑災(zāi)糧籠絡(luò)災(zāi)民，以響應(yīng)他們振臂一呼，與武皇爭(zhēng)奪天下。

武則天對(duì)狄仁杰此次立的功勞大加贊賞，隨即狄仁杰也為他們解開了青銅樹中玄機(jī)。兇手在青銅樹上下了劇烈的蛇毒，而武皇與太平公主所用的唇紙之中也潛藏著毒素，兩種毒素能夠相互作用，通過呼吸進(jìn)入人體，毒發(fā)傷人，因此武皇和公主是將此毒素吸入了體內(nèi)，這才先后中毒。